Interacción con otros programas de postgrado
El PPBA posee alianzas con varios Programas de Postgrado de la UFPA y también con otras instituciones, contribuyendo con el desarrollo de la estructura curricular del Programa que presenta como principal característica la flexibilidad. Los discentes del PPBA cuentan con la posibilidad de cursar disciplinas en los programas de Ecología Acuática y Pesca, Zoología, Antropología, Ciencia Animal, entre otros. En el marco del currículo, se destaca también la disciplina denominada "Seminarios de Integración", impartida por profesores de la UFPA y de otras instituciones. Consiste en la realización de charlas y defensas de temática diversificada, a fin de atender la propuesta de la enseñanza multidisciplinaria ofrecida por el programa.
Integración con la Graduación
El PPBA está en perfecta consonancia con los cursos de pregrado del Campus de Bragança, que incluyen la Licenciatura en Ciencias Biológicas, implementada en 1999, el Bachillerato en Ingeniería de Pesca, implementado en 2004/05, y el curso de Ciencias Naturales, implementado en El Campus cuenta además con cursos de Pedagogía, Historia, Letras, y Matemáticas, siendo que a pesar de la diversidad entre las áreas de concentración, existe una integración efectiva con el PPBA, donde todos los profesores del Programa también actúan en la Graduación, así como los docentes de la Graduación son alumnos del Programa, tanto a nivel de Maestría y Doctorado, desarrollando disertaciones y tesis principalmente ligadas al manejo costero, educación ambiental y aspectos socioeconómicos de la pesca y extractivismo en la zona costera.
Calificación de servidores
El programa tiene participación en el Programa Institucional de Apoyo a la Calificación de Servidores (PADT) de la UFPA, donde en 2011 ingresaron en el programa ocho servidores, siendo cinco en el curso de Maestría y tres en el Doctorado. Para 2013, también se pusieron a disposición nueve nuevas vacantes para docentes y servidores de la institución dentro del programa PADT.